Что делать, если в период проведения проверки не было возможности предоставить исправленные документы, например, счет-фактуры, и инспектора вынесли решение о привлечении к ответственности. Примет ли суд во внимание такие документы?

Конечно, примет. Часто на практике приходится сталкиваться с тем, что именно счет-фактуру поставщик предоставил исправленную поздно, проверка закончилась и предприятию грозит не просто уплата НДС, но еще и начисленные пени и штраф. В таком случае на суде можно заявить ходатайство о приобщении к материалам дела соответствующих документов, перечислить их и описать те причины, которые послужили тому, что такие документы «опоздали».